夏日的一天，紅發(fā)女孩瑪麗（杉咲花配音）被送到阿姨夏洛特所在的鄉(xiāng)間小屋度假。初來乍到，瑪麗對周遭的一切還不那么適應(yīng)，特別是調(diào)皮男孩彼得（神木隆之介配音）有意和她對著干，令瑪麗實(shí)在高興不起來。偶然一次的林間探險(xiǎn)，瑪麗見到了傳說中的魔法之花“夜間飛行”，還找到了一柄破掃帚。偏偏這把魔法掃帚載著瑪麗飛上天空，來到了專門培養(yǎng)魔法師的恩德學(xué)園。在這個(gè)神奇的所在，瑪麗受到曼布勒切克女士（天海佑希配音）的殷勤接待...